Hybridation des puces

Un service d'hybridation (du contrôle qualité des ARNs à l'hybridation) et d'analyse vous est proposé pour les puces produites au sein de la plateforme et les puces commerciales (Affymetrix et Agilent). Les lames " maison " et les lames Agilent sont hybridées selon le protocole " Agilent " (four, cassettes, lavages…). Les lames Affymetrix selon le protocole Affymetrix.

Services proposés

Contrôle qualitatif et quantitatif des ARNs (totaux ou miRNA) par spectrophotométrie (Nanodrop® ND-1000) et électrophorèse capillaire (Bioanalyzer d'Agilent)

Amplification des ARN totaux de départ (aminoallyl amplification kit, Ambion)

Marquage fluorescent bicolore (Cy3, Cy5 : puces pangénomiques. Alexa 532 et 647 : puces miRNA) simple ou en flip/flop (dye swap)

Hybridation, lavage et scanning des puces

Quantification des puces grâce au logiciel Genepix (Axon)